Die Kommission E ist eine wissenschaftliche Einrichtung der Bundesrepublik. Sie ist Teil des Bundesinstituts für Arzneimittel und Medizinprodukte (BfArM).

Von 1980 bis 1994 hat die Kommission E wissenschaftliches und erfahrungsheilkundliches Material zu erwünschten und unerwünschten Wirkungen von Heilpflanzen und deren Wirkstoffen zusammengestellt und ausgewertet. Das Ergebnis sind die bis heute gültigen Monographien. Diese sind die Grundlage für die Neuzulassung und Nachzulassung pflanzlicher Arzneimittel.

Die Mitglieder der Kommission E wechseln alle 3 Jahre und verfügen alle über besondere Kenntnisse der wissenschaftlichen und/oder praktischen Phytotherapie. Die Kommission setzt sich interdisziplinär zusammen und vereint Experten für Toxikologie, experimentelle Pharmakologie, Biometrie, pharmazeutische Biologie sowie Ärzte und Heilpraktiker, die Phytopharmaka praktisch einsetzen.